Les premières informations sur San Clemente, île au sud de la lagune vénitienne, concernent un hôpital construit pour accueillir les pèlerins qui se rendaient sur la Terre sainte à l’époque des croisades.

En 1160, l’hôpital a été transformé en monastère. Il a été complètement reconstruit vers le milieu du XV° siècle pour recevoir les invités illustres de l’Etat vénitien.

A partir de 1630, quand Venise a été frappée par la peste, qui y avait peut-être été transportée par un ambassadeur du duc de Mantoue, invité du couvent, l’île est tombée en disgrâce pendant plusieurs décennies.

Au début du XIX° siècle, avec les lois napoléoniennes sur la suppression des ordres religieux, le couvent a été fermé et ses biens vendus aux enchères. En 1855, le gouvernement autrichien a fait démolir le couvent pour y faire bâtir un grand hôpital, psychiatrique pour femmes.

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